食環研では、食品衛生検査施設等における検査等の業務の管理の実施について（厚生省生活衛生局食品保健課長通知 衛食第117号）を参考とし、検査データが常に一定の正確度と精密度を保持した測定結果が報告されるように、統計学的解析を含めた様々な手法を利用して、分析操作を管理またはその管理方法の妥当性を検証しています。
・食環研は 登録衛生検査所（第41号） 及び 計量証明事業者（環第51号） です。
・食環研はGCP（29動薬第1665号-3）GLP（30動薬第1018号-3）GLP（24消安第4322号）適合機関です。
・食環研は ISO/IEC 17025:2017の取得機関です。
・2017年3月にGMPの許可 許可番号 H29製造薬第399
・2018年11月に学術研究機関の指定を更新しました。
外部精度管理
国際的に認知されている外部精度管理管理機関であるFAPAS及びFEPASの技能試験に毎年参加しています。
また、群馬県が行う臨床検査精度管理調査に毎年参加する他、群馬県衛生環境研究所（群馬県食品安全検査センター）の食品検査クロスチェック（残留農薬）にも毎回参加しています。
