【コラム】DNAシーケンス解析③:シーケンス波形の見方

今回はDNAシーケンサーから出力された波形データの見方について説明します。
シーケンサーが読み取った蛍光色素は、解析用ソフトウェアによって以下のような波形データとして出力されます。
 
DNAシークエンサーの仕組み
 
波形データの縦軸は蛍光色素のシグナル強度を、横軸は時間(塩基の位置)を表しています。シグナル強度は読み取った蛍光色素量が多いほど強くなる傾向があります。
波形の色は各塩基、A、T、C、Gに対応する色で出力され、上図の場合、波形の下部のアルファベットは解析ソフトウェアによって決定された塩基が表示されています。
 

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